数据分析,单细胞转录组测序(Single-cell

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RNA-sequencing)是指在单细胞水平上对RNA进行高通量测序和分析的新技术。
不同于常规BulkSequencing(组织或细胞群测序)得到的结果只是大量细胞的平均表达水平,单细胞测序能够深入挖掘细胞特异性的信息。
目前,单细胞测序已广泛应用于肿瘤异质性、免疫微环境、神经科学、胚胎发育、细胞分化等领域的研究。
最近,吉凯基因引进单细胞测序平台——BDRhapsodyTM,将为客户提供更大规模、更加灵活、更为全面的单细胞测序服务。
优势 高效 每个样本可测100~10000个细胞2天内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库 灵活 抗体标签技术可实现多样本混合捕获可选择全转录组测序或目标基因测序 可靠 利用成像系统对单细胞捕获过程进行质控单细胞捕获效率高达80%,多细胞比例仅为4.7% 整合 可同时检测单个细胞的mRNA水平与蛋白水平 实验流程 数据分析 消除样本间差异 细胞类群注释 细胞分群(t-SNE,UMAP,Force-directed
graphdrawing) 不同cluster转录本表达丰度分布统计 不同cluster细胞数目统计 应用方向 肿瘤异质性KimC,GaoR,SeiE,etal.ChemoresistanceEvolutioninTriple-NegativeBreastCancerDelineatedbySingle-CellSequencing.Cell2018,173
(4):879-893.肿瘤免疫微环境ZhengC,ZhengL,YooJK,etal.LandscapeofInfiltratingTCellsinLiverCancerRevealedbySingle-CellSequencing.Cell2017,169
(7):1342-1356.神经科学LiCL,LiKC,WuD,etal.Somatosensoryneurontypesidentifiedbyhigh-coveragesingle-cellRNA-sequencingandfunctionalheterogeneity.CellRes2015,26
(1):83-102. 胚胎发育 LiL,DongJ,YanL,etal.Single-CellRNA-SeqAnalysisMapsDevelopmentofHumanGermlineCellsandGonadalNicheInteractions.CellStemCell2017,20
(6):858-873 细胞分化 BachK,PensaS,GrzelakM,etal.Differentiationdynamicsofmammaryepithelialcellsrevealedbysingle-cellRNAsequencing.NatCommun2017,8
(1):2128. Marker基因分析 不同病人每个cluster的转录本表达丰度和细胞数目统计伪时间轴分析患者之间的代谢特征差异分析单细胞基因表达驱动因子分析 生物单细胞测序服务 ——引进BDRhapsodyTM技术平台 更多信息请登录吉凯基因官网,或致电来函吉凯基因。
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