先开活体成像仪电源（启动仪器），然后开电脑显示器及主机电源
（2）待仪器稳定后（大约5～10分钟），即可双击电脑桌面Indigo软件，输入 用户名Admin和密码Admin，点击Enter，即可进入仪器控制软件界面
（3）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“MeasuringTemplates”后，右键点 击出现下拉菜单，点击“NewMeasuringTemplate”，出现“NewTemplate”对话框
（4）对话框中创建测定模板，TemplateName给模板命名，一般以日期+姓名命名，例如20170322-zx；Comment对模板进行简要说明，例如Takephotos
（5）点击“Next”按钮，出现新的对话框，设置如何获取图像数据DataAcquisition
（6）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Photo”，出现“Photo”对话框
（7）设置曝光时间ExposureTime【s】：0.1s（默认值）；设置拍照时照光强度IlluminationIntensity【%】：10（默认值）
（8）鼠标点击“Next”按钮，出现“Photo/PostProcessor”对话框，仅将“CosmicSuppression”设置为“Enabled”，其它参数设置为默认值
（9）设置好之后，点击“Finish”按钮，再次点击“Finish”按钮，创建测定模板完成（10）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“ControllerTemplates”后，右键点击出现下拉菜单，点击“NewControllerTemplate”，出现编辑控制模板对话框（11）TemplateName给控制模板命名，例如20170322-zx；Comment给控制模板进行说明，例如TakePhotos（12）鼠标点击“Next”按钮，进入设置控制模板参数对话框，给植物连续拍照主要对光照条件进行设置，点击“Add”按钮，选中“Illumination”出现光照条件对话框，填写光照输出水平，默认值为50％，填写好之后，两次点击“Finish”按钮，完成创建控制模板 （13）鼠标左击软件界面左侧“Projects＆Analysis”，选择“AvailableProjects”文件夹，右击鼠标，选中下拉菜单中“NewProject”出现创建方案对话框 （14）对话框中创建方案，ProjectName给模板命名，一般以日期+姓名命名，例如“20170322-zx”；Comment对方案进行简要说明，例如Takephotos （15）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，对存储图片的文件夹进行命名，一般为格式为：前缀+年-月-日+后缀，创建文件夹数量（图像存储位置）：一般1个样品创建1个文件夹 （16）鼠标点击“Next”按钮，实验前模板选择“None”，也可在下拉菜单中选择其它模板；实验模板选择上述编好的模板20170322-zx；实验结束后模板选择“None”，也可在下拉菜单中选择其它模板 （17）点击“Next”进入AnalyzeSettings“NewProject”对话框，PhotoDisplayRange和DataRange可使用默认值，也可使用CostomSettings，手动进行设置 （18）点击“Next”进入UserRights“NewProject”对话框，可不用理会，直接点击“Finish按钮，完成创建方案 （19）点击左侧“Createanewschedule”，为测定模板创建“使用计划表”（20）选中“ScheduleMeasurement”，点击“Next”按钮，在“SelectProjectand IdentitytoAcquire”下面的对话框中选择方案名称为“20170322-zx”，另一个对话框中选择图像存入的文件夹名称（21）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置开始运行日期和时间，拍照总次数以及前后两次拍照的间隔时间，OverallCycles拍照的总次数；Delay/Cycletime前后两次拍照的间隔时间（22）点击“Finish”按钮，完成创建测定模板“使用计划表”（23）点击左侧“Creatanewschedule”，选中“ScheduleControllerTemplate”后，点击“Next”按钮，出现创建控制模板“使用计划表”对话框（24）在“SelectProjectandIdentitytoAcquire”下面的对话框中选中方案名称，例如20170322－zx（25）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置控制模板开始发挥作用的日期和时间，光照总次数（OverallCycles），两次光照之间的间隔时间 （Delay/CycleTime）（26）点击“Finish”按钮，完成创建控制模板“使用计划表”（27）点击软件左侧蓝色“Acquisition”，选择“StartanAcquisition”，出现对话 框，选择方案名称20170322-zx，选择文件夹名称（28）在CCD相机镜头下面放置好样品，对好焦距（以成像较为清晰为准），点 击“Start”按钮，即可开始图像采集 活体植物的荧光检测-活体成像仪
（1）先开活体成像仪电源，然后开电脑显示器及主机电源
（2）待仪器稳定后（大约5～10分钟），即可双击电脑桌面Indigo软件，输入 用户名Admin和密码Admin，点击Enter，即可进入仪器控制软件界面
（3）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“MeasuringTemplates”后，右键点 击出现下拉菜单，点击“NewMeasuringTemplate”，出现“NewTemplate”对话框
（4）对话框中创建模板，TemplateName给模板命名，一般以日期+姓名命名，也可以其它格式进行命名，例如20170323-3；Comment对模板进行简要说明，例如Fluorescence
（5）点击“Next”按钮，出现新的对话框，设置如何获取图像数据DataAcquisition
（6）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Fluorescence”，出现“Fluorescence”对话框
（7）设置曝光时间【s】：0.1s（默认值）；Gain设置为“Low”或“High”，一般设置为“High”，使相机具有最大增益值；Readout设置“Slow”或“Fast”，一般设置为“Fast”，使相机具有最大读出速度
（8）鼠标点击“Next”按钮，出现“PostProcessor”对话框，仅将“CosmicSuppression”设置为“Enabled”，其它参数设置为默认值
（9）鼠标点击“Next”按钮，进入“ExcitationFilter”对话框，设置激发光波长（滤光片）及灯值能量，本仪器仅安装4种激发光波长的滤光片，分别为475nm、530nm、630nm、700nm（10）鼠标点击“Next”按钮，进入“EmissionFilter”对话框，设置发射光波长，仅需在Wavelength填写发射光波长，在CCD相机镜头前手动安装相匹配的滤光镜（检测发射光）（11）单次点击“Finish”按钮，完成对“Fluorescence”设置（12）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Photo”，出现“Photo”对话框 （13）设置曝光时间（0.1秒，默认值），光照强度（10%，默认值），CloseIristoSharperImage（设置为NO），点击“Finish”按钮，完成对“Photo”设置 （14）左击软件界面左侧“Applications”，选中Availabletemplate里面的“ControllerTemplates”，右击选择下拉菜单中的“NewControllerTemplate”，出现控制模板设置对话框 （15）给控制模板命名Templatename，给控制模板进行注释说明Comment，注意：测定模板、控制模板和方案名称最好一致 （16）点击“Next”，设置控制参数，荧光检测设置包括ArtificialDaylight、Daylighton、Delay、Daylightoff、Delay五个步骤，ArtificialDaylight对2个LED灯光成分进行设置，例如白光、红光、蓝光、远红光比例设置，Daylighton/Delay开灯时常设置，Daylightoff/Delay关灯时长设置。
一般开灯时长设置较长/关灯时长设置较短（只有几秒钟）。
LED灯开关设置主要作用是在关闭LED灯时，相机拍照可检测荧光，避免LED灯光对荧光信号的干扰 （17）单次点击“Finish”按钮，完成荧光检测控制模板的创建（18）鼠标左击软件界面左侧“Projects＆Analysis”，选择“AvailableProjects” 文件夹，右击鼠标，选中下拉菜单中“NewProject”出现创建方案对话框，填写方案名称，例如20170323-
3，并对方案简要说明（Comment），例如Fluorescence（19）点击“Next”按钮，进入“IdentityNamingNewProject”对话框，对存储图片的文件夹进行命名，格式：前缀＋年－月－日＋后缀，文件夹数量根据样品数量确定（20）点击“Next”按钮，出现“AcquisitionSettings”对话框，Measurement选择20170323-
3，其它设置在None（21）点击“Next”进入AnalyzeSettings“NewProject”对话框，PhotoDisplayRange和DataRange可使用默认值，也可使用CostomSettings，手动进行设置（22）点击“Next”进入UserRights“NewProject”对话框，可不用理会，直接点击“Finish按钮，完成创建方案 （23）点击左侧“Createanewschedule”，为方案创建“使用计划表”（24）选中“ScheduleMeasurement”，点击“Next”按钮，在“SelectProjectand IdentitytoAcquire”下面的对话框中选择方案名称为“20170322-3”，另一个对话框中选择图像存入的文件夹名称（25）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置开始运行日期和时间，拍照总次数以及前后两次拍照的间隔时间，OverallCycles拍照的总次数；Delay/Cycletime前后两次拍照的间隔时间（26）点击“Finish”按钮，完成检测模板“使用计划表”的设置（27）点击软件界面左侧“Acquision”，在下拉菜单中选中“Createanewschdule”并双击，为控制模板创建“使用计划表”（28）选中“ScheduleControllerTemplate”，点击“Next”按钮（29）在“ScheduleControllerTemplate”下拉菜单中填写控制模板名称，点击“Next”按钮（30）编辑控制模板“使用计划表”，包括运行时间和日期，运行总次数（OverallCycles），两次运行之间的时间间隔（Delay/CycleTime），点击“Finish”按钮，完成控制模板使用计划表的设置（31）点击软件左侧蓝色“Acquisition”，选择“StartanAcquisition”，出现对话框，选择方案名称20170322-
3，选择文件夹名称（32）在CCD相机镜头下面放置好样品，将光纤接口插入到NightSHADE暗箱右上侧转换接口（有环状/线状/鹅颈三种激发光源，可根据样品进行选择），调整激发光照射角度，确保激发光照亮整个样品，点击“Start”按钮，即可开始图像采集
（2）待仪器稳定后（大约5～10分钟），即可双击电脑桌面Indigo软件，输入 用户名Admin和密码Admin，点击Enter，即可进入仪器控制软件界面
（3）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“MeasuringTemplates”后，右键点 击出现下拉菜单，点击“NewMeasuringTemplate”，出现“NewTemplate”对话框
（4）对话框中创建测定模板，TemplateName给模板命名，一般以日期+姓名命名，例如20170322-zx；Comment对模板进行简要说明，例如Takephotos
（5）点击“Next”按钮，出现新的对话框，设置如何获取图像数据DataAcquisition
（6）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Photo”，出现“Photo”对话框
（7）设置曝光时间ExposureTime【s】：0.1s（默认值）；设置拍照时照光强度IlluminationIntensity【%】：10（默认值）
（8）鼠标点击“Next”按钮，出现“Photo/PostProcessor”对话框，仅将“CosmicSuppression”设置为“Enabled”，其它参数设置为默认值
（9）设置好之后，点击“Finish”按钮，再次点击“Finish”按钮，创建测定模板完成（10）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“ControllerTemplates”后，右键点击出现下拉菜单，点击“NewControllerTemplate”，出现编辑控制模板对话框（11）TemplateName给控制模板命名，例如20170322-zx；Comment给控制模板进行说明，例如TakePhotos（12）鼠标点击“Next”按钮，进入设置控制模板参数对话框，给植物连续拍照主要对光照条件进行设置，点击“Add”按钮，选中“Illumination”出现光照条件对话框，填写光照输出水平，默认值为50％，填写好之后，两次点击“Finish”按钮，完成创建控制模板 （13）鼠标左击软件界面左侧“Projects＆Analysis”，选择“AvailableProjects”文件夹，右击鼠标，选中下拉菜单中“NewProject”出现创建方案对话框 （14）对话框中创建方案，ProjectName给模板命名，一般以日期+姓名命名，例如“20170322-zx”；Comment对方案进行简要说明，例如Takephotos （15）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，对存储图片的文件夹进行命名，一般为格式为：前缀+年-月-日+后缀，创建文件夹数量（图像存储位置）：一般1个样品创建1个文件夹 （16）鼠标点击“Next”按钮，实验前模板选择“None”，也可在下拉菜单中选择其它模板；实验模板选择上述编好的模板20170322-zx；实验结束后模板选择“None”，也可在下拉菜单中选择其它模板 （17）点击“Next”进入AnalyzeSettings“NewProject”对话框，PhotoDisplayRange和DataRange可使用默认值，也可使用CostomSettings，手动进行设置 （18）点击“Next”进入UserRights“NewProject”对话框，可不用理会，直接点击“Finish按钮，完成创建方案 （19）点击左侧“Createanewschedule”，为测定模板创建“使用计划表”（20）选中“ScheduleMeasurement”，点击“Next”按钮，在“SelectProjectand IdentitytoAcquire”下面的对话框中选择方案名称为“20170322-zx”，另一个对话框中选择图像存入的文件夹名称（21）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置开始运行日期和时间，拍照总次数以及前后两次拍照的间隔时间，OverallCycles拍照的总次数；Delay/Cycletime前后两次拍照的间隔时间（22）点击“Finish”按钮，完成创建测定模板“使用计划表”（23）点击左侧“Creatanewschedule”，选中“ScheduleControllerTemplate”后，点击“Next”按钮，出现创建控制模板“使用计划表”对话框（24）在“SelectProjectandIdentitytoAcquire”下面的对话框中选中方案名称，例如20170322－zx（25）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置控制模板开始发挥作用的日期和时间，光照总次数（OverallCycles），两次光照之间的间隔时间 （Delay/CycleTime）（26）点击“Finish”按钮，完成创建控制模板“使用计划表”（27）点击软件左侧蓝色“Acquisition”，选择“StartanAcquisition”，出现对话 框，选择方案名称20170322-zx，选择文件夹名称（28）在CCD相机镜头下面放置好样品，对好焦距（以成像较为清晰为准），点 击“Start”按钮，即可开始图像采集 活体植物的荧光检测-活体成像仪
（1）先开活体成像仪电源，然后开电脑显示器及主机电源
（2）待仪器稳定后（大约5～10分钟），即可双击电脑桌面Indigo软件，输入 用户名Admin和密码Admin，点击Enter，即可进入仪器控制软件界面
（3）鼠标左键点击Applications，鼠标选中“MeasuringTemplates”后，右键点 击出现下拉菜单，点击“NewMeasuringTemplate”，出现“NewTemplate”对话框
（4）对话框中创建模板，TemplateName给模板命名，一般以日期+姓名命名，也可以其它格式进行命名，例如20170323-3；Comment对模板进行简要说明，例如Fluorescence
（5）点击“Next”按钮，出现新的对话框，设置如何获取图像数据DataAcquisition
（6）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Fluorescence”，出现“Fluorescence”对话框
（7）设置曝光时间【s】：0.1s（默认值）；Gain设置为“Low”或“High”，一般设置为“High”，使相机具有最大增益值；Readout设置“Slow”或“Fast”，一般设置为“Fast”，使相机具有最大读出速度
（8）鼠标点击“Next”按钮，出现“PostProcessor”对话框，仅将“CosmicSuppression”设置为“Enabled”，其它参数设置为默认值
（9）鼠标点击“Next”按钮，进入“ExcitationFilter”对话框，设置激发光波长（滤光片）及灯值能量，本仪器仅安装4种激发光波长的滤光片，分别为475nm、530nm、630nm、700nm（10）鼠标点击“Next”按钮，进入“EmissionFilter”对话框，设置发射光波长，仅需在Wavelength填写发射光波长，在CCD相机镜头前手动安装相匹配的滤光镜（检测发射光）（11）单次点击“Finish”按钮，完成对“Fluorescence”设置（12）鼠标点击“Add”按钮，选择下拉菜单中的“Photo”，出现“Photo”对话框 （13）设置曝光时间（0.1秒，默认值），光照强度（10%，默认值），CloseIristoSharperImage（设置为NO），点击“Finish”按钮，完成对“Photo”设置 （14）左击软件界面左侧“Applications”，选中Availabletemplate里面的“ControllerTemplates”，右击选择下拉菜单中的“NewControllerTemplate”，出现控制模板设置对话框 （15）给控制模板命名Templatename，给控制模板进行注释说明Comment，注意：测定模板、控制模板和方案名称最好一致 （16）点击“Next”，设置控制参数，荧光检测设置包括ArtificialDaylight、Daylighton、Delay、Daylightoff、Delay五个步骤，ArtificialDaylight对2个LED灯光成分进行设置，例如白光、红光、蓝光、远红光比例设置，Daylighton/Delay开灯时常设置，Daylightoff/Delay关灯时长设置。
一般开灯时长设置较长/关灯时长设置较短（只有几秒钟）。
LED灯开关设置主要作用是在关闭LED灯时，相机拍照可检测荧光，避免LED灯光对荧光信号的干扰 （17）单次点击“Finish”按钮，完成荧光检测控制模板的创建（18）鼠标左击软件界面左侧“Projects＆Analysis”，选择“AvailableProjects” 文件夹，右击鼠标，选中下拉菜单中“NewProject”出现创建方案对话框，填写方案名称，例如20170323-
3，并对方案简要说明（Comment），例如Fluorescence（19）点击“Next”按钮，进入“IdentityNamingNewProject”对话框，对存储图片的文件夹进行命名，格式：前缀＋年－月－日＋后缀，文件夹数量根据样品数量确定（20）点击“Next”按钮，出现“AcquisitionSettings”对话框，Measurement选择20170323-
3，其它设置在None（21）点击“Next”进入AnalyzeSettings“NewProject”对话框，PhotoDisplayRange和DataRange可使用默认值，也可使用CostomSettings，手动进行设置（22）点击“Next”进入UserRights“NewProject”对话框，可不用理会，直接点击“Finish按钮，完成创建方案 （23）点击左侧“Createanewschedule”，为方案创建“使用计划表”（24）选中“ScheduleMeasurement”，点击“Next”按钮，在“SelectProjectand IdentitytoAcquire”下面的对话框中选择方案名称为“20170322-3”，另一个对话框中选择图像存入的文件夹名称（25）鼠标点击“Next”按钮，出现对话框，设置开始运行日期和时间，拍照总次数以及前后两次拍照的间隔时间，OverallCycles拍照的总次数；Delay/Cycletime前后两次拍照的间隔时间（26）点击“Finish”按钮，完成检测模板“使用计划表”的设置（27）点击软件界面左侧“Acquision”，在下拉菜单中选中“Createanewschdule”并双击，为控制模板创建“使用计划表”（28）选中“ScheduleControllerTemplate”，点击“Next”按钮（29）在“ScheduleControllerTemplate”下拉菜单中填写控制模板名称，点击“Next”按钮（30）编辑控制模板“使用计划表”，包括运行时间和日期，运行总次数（OverallCycles），两次运行之间的时间间隔（Delay/CycleTime），点击“Finish”按钮，完成控制模板使用计划表的设置（31）点击软件左侧蓝色“Acquisition”，选择“StartanAcquisition”，出现对话框，选择方案名称20170322-
3，选择文件夹名称（32）在CCD相机镜头下面放置好样品，将光纤接口插入到NightSHADE暗箱右上侧转换接口（有环状/线状/鹅颈三种激发光源，可根据样品进行选择），调整激发光照射角度，确保激发光照亮整个样品，点击“Start”按钮，即可开始图像采集
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