主编：赵路编辑：闫洁校对：傅克伟E-mail押lzhao＠
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2016年10月11日星期二Tel：（010）62580617
尊重你的细胞
科学家警告微小差异改变实验结果
当AlastairKhodabukus试着在美国加州大学戴维斯分校的新实验室制作肌肉纤维时，他发现一些奇怪的事情：这些组织在痉挛。
数年来，他一直在用同样的鼠源克隆技术培养纤维，但这些却与众不同。
与之前他在英国邓迪的实验室培育出的纤维相比，它们需要更多的葡萄糖，而包含的能促进更快放松及不易疲劳的蛋白质则更少。
Khodabukus认为，这些不同归因于美国牛的饲养方式不同。
大多数大学实验室采用牛胎儿血清（FBS）培养细胞。
牛的饮食、地理位置、年龄、是否使用激素或抗体，以及牛胎儿孕周等均会产生影响。
FBS被作为培养基的补充物，它能影响人造组织的厚度，并能使产物模拟细胞活动，甚至影响表面接受器对给定化合物的响应。
“FBS就像笼罩在头上的乌云，我们不知道它实际是什么或不是什么。
”Khodabukus说。
而血清只是研究人员在研究细胞时需要考虑的诸多因素之
一。
在去年召开的美国国立卫生研究院（NIH）细胞培养和再生研讨会上，生物制药公司“吉利德科学”的癌症生物学家RichardNeve就担忧，研究人员将变得不堪重负。
“很多实验室面临大量问题。
” 一般而言，相关研究的最基本步骤是确保细胞的基因一致性。
而且，细胞行为也会受到浓度、增殖率、培养基、污染物和培养时间等的影响。
而血清是细胞培养基中最常见的补充物，并至少应保持一致。
通常，人类血清包含数千不同的蛋白质和小分子。
而FBS复杂性相似，且富含支持胎儿快速生长的物质。
致力于研发血清替代物的Essential制药公司的首席科学官AdamElhofy表示，在血清中，大部分细胞并不与血液直接接触，而是被液体包裹着。
“血清里还富含荷尔蒙、生长因子和其他信号分子。
” 走向无血清 为了克服障碍，试剂公司已经开发出无血清培养基。
科学家也在追求“生物工艺”的应用，例如，药用蛋白质和疫苗的生产。
而那些了解细胞对培养条件微小变化十分敏感的干细胞研究者也对此十分热衷。
出于对一致性的担忧和推动转化医学的愿望，越来越多的研究者开始注意如何对待他们的细胞。
MilliporeSigma公司研究部战略营销主管KenYoon表示，这些都在鼓励科学家远离血清。
但无血清培养基并非总是可行或实际的。
“如果我们能不再用FBS，而是有一些更确定的东西，所有人都同意这是件大事。
”美国国家综合医学科学研究所JonLorsch说，“问题是这有多切合实际？我们不知道答案。
” 大部分无血清剂型只针对特定细胞类型或相关细胞系群。
例如，供应商为中国仓鼠卵巢细胞提供无血清培养基。
但ScienCell实验室研发副总监JenniferWelser-Alves指出，这些培养基并不适用于所有细胞类型：许多原始细胞被移出后，仍需要血清才能生长。
“你能做的增加细胞并保持其增长的所有事情都是必要的。
”她说。
一些培养基要求增加至少2%的FBS，低剂量的血清有助于减少可变性。
“有的人博士学位泡汤了、拨款丢了，甚至几年的工作白干了，原因就是没有进行简单的质量控制。
图片来源：TekImage 不过，芒特普林森的培养基顾问PaulPrice指出，即便具有可行性，很多研究者也不希望花费时间或冒险掐断细胞的血清供应。
“自1980年以来，人们一直说血清将成为历史，但到现在它仍然流行。
” 另外，Khodabukus提到，骨骼肌纤维尚没有商用培养制剂。
他花费两年时间修改了配方，结合了数十种生长因子和其他信号分子。
但纤维性能随不同血清出现变化，打乱了他的研究计划。
“我计划用今后所有时间研究这一领域，如果能成功，则将能用于全世界每个实验室。
” 无法摆脱的血清 Khodabukus前博士后导师、加州大学戴维斯分校的KeithBaar则依靠一种更普通的解决方案：将实验室温度降低以储存血清。
当血清快要用尽时，他会订购和检验至少4批货源，观察他们培养的细胞的效能，找出与当前实验最匹配的。
之后，他购买了100瓶同样的血清。
虽然这会花费其实验室2.5万美元，但也意味着他们能继续实验，不用花数月时间检验更多的血清。
科罗拉多大学癌症生物学家MatthewSikora指出，不检验其血清的研究者可能陷入麻烦。
Sikora使用乳腺癌细胞系研究“弱雌激素”的效应。
他购买了经过木炭处理的血清，以便剥离类胆固醇激素和其他多脂分子。
然后他检验了血清中含有或缺乏雌激素受体的细胞，如果血清中的激素能被有效移除，那么这些细胞的增值效率应该一致。
去年，他和同事不得不停止实验6个月，当 时连续批次的血清均无法达到其实验目标。
不同的荷尔蒙容量会“完全推翻”对一种癌症药物如何工作的解释。
Sikora认为，血清中的未知变化能解释他与合作者不能得到一致结果的原因。
即便研究人员进行批次检验，他们也可能不知道应当注意什么。
但奥兰治儿童医院细胞和发育生物学家MariellaSimon表示，研究人员永远需要仔细。
理论上，他们应该准备充足的血清完成整个实验。
在使用一批新血清时，他们应该确保没有试剂发生变化，并与足够的旧血清进行比对，以避免因血清变化而出现的奇怪结果。
另外，污染也会扰乱实验。
最阴险的破坏者之一就是支原体。
这种微小的细菌能偷偷溜过消毒器的边缘，并能抵御多种抗生素。
它能吃掉细胞的营养并能改变DNA及蛋白质合成。
传统的支原体检验需要数周，并仍会遗漏一些稀有菌株。
美国模式培养物保藏所标准化工作负责人YvonneReid提到，基于聚合酶链反应（PCR）的检验能更快速准确地找到答案。
为了避免血清被污染，一些研究人员还选择使用伽马射线。
包括支原体在内的一些普通污染物均对射线十分敏感。
但射线也会损害蛋白质和生物活性分子的生长。
许多供应商也提供经过伽马射线照射的血清，国际血清产业联盟也成立了工作组检验这些血清的效果。
错误无处不在 细胞所处的物理环境具有深远影响。
美国波士顿威斯研究所研究人员发现，培养基仅出现变形和流动就会改变细胞。
不同品牌的实验 室器皿能将不同的化学物质释放到培养基中， 并扰乱细胞代谢研究。
经过认真考虑的试剂添加也能以意想不到 的方式改变细胞代谢：抗生素能损害线粒体活 性。
即便实验室冰箱的玻璃门也能摧毁研究，原 因是培养基中的一些化学物质对光线十分敏 感。
此外，细胞在给定的培养皿中的生长也不相 同。
在这些实验中，细胞本身就变成最大的变 数。
英国伦敦大学学院癌症研究员JohnMasters 指出，没有简单快速的方法能知道细胞是否符 合要求。
美国犹他州细胞培养顾问LelandFoster则 认为，“实验室要远离这种变量则需要有专业人 员指导。
”他指出，培养细胞最好由细胞培养专 家进行，而非实习生，前者能分辨出细胞在“微 笑还是皱眉头”。
在快速生长或相对稳定阶段的细胞，其反 应并不相同。
如果它们在培养基中的时间过 长，还会发生其他变化，并影响增殖。
即便能 确证细胞的遗传统一性，细胞的其他重要属 性也无法确证。
Reid提到，由于存在如此多的 不确定性，研究人员需要一周或更多时间优 化细胞生长，并在实验开始前总结生长概况。
生长概况能告知研究人员何时收获细胞、何 时检测等。
而重要的是，研究人员必须时刻保持警惕。
“没有一套实验规程适合所有人。
”Neve说。
但 忽视细胞的研究人员将会遇到更多困难。
“有的 人博士学位泡汤了、拨款丢了，甚至几年的工作 白干了，原因就是没有进行简单的质量控制。
” Masters说。
（张章编译） 科学线人 全球科技政策新闻与解析 俄罗斯中止俄美核研发协议 即便俄罗斯暂停同美国的核研发合作，在波兰和其他国家消除高浓缩铀的共同努力似乎仍在进行。
图片来源：
U.S.NNSA 美国官员表示，即便是在冷战期间，事情也从 未如此糟糕。
近日，俄罗斯政府暂停了一项和美国 就核研发合作达成的协议，并且终止了另一项就 改装俄罗斯研究用反应堆使其不再使用武器级铀 燃料达成的协议。
虽然这些举措在很大程度上是 象征性的，但还是令这两个全球实力最强的核大 国之间的关系跌入新的低谷，并且在25年前苏联 解体后形成密切关系的核科学界引起隔阂。
在宣布暂停研发协议时，俄罗斯政府将其称 为对美国制裁采取的“对策”。
在2014年3月克里 米亚事件后，美国对俄罗斯实施了制裁，并为乌克 兰东部地方武装提供支持。
有消息人士表示，叙利 亚和平谈判的崩溃以及美国对俄罗斯参与轰炸叙 利亚阿勒波的指责，似乎促成了俄罗斯延迟的反 击。
10月3日，俄罗斯还退出了同美国达成的另
一 项协议。
根据协议，双方将致力于消除存放在两国 的34吨钚。
这些钚足以生产约1.7万颗炸弹。
“看到俄罗斯这样做，我们真的非常遗憾。
”美 国能源部国家核能安全管理局（NNSA）一名官员 表示。
总部位于华盛顿、倡导核不扩散的非营利性 机构———“核威胁倡议”的核材料安全和危害最小 化项目副主席AndrewBieniawski则认为，作为迄 今拥有最大核武库的两个国家，“美国和俄罗斯肩 负着合作共事的特殊责任”。
上述NNSA官员表示，俄罗斯暂停于2013 年9月签订的核研发协议“尤其令人遗憾”。
他认 为，该协议是“苏联解体后双方以平等地位合作 达成的首个框架协议”。
在1991年苏联解体后， 美国对俄罗斯核设施的援助主要集中在确保核 材料安全并将核武器专家分配到民用项目上。
不 过，俄罗斯总统弗拉基米尔·普京一直对美国伸 出的援手感到恼火。
随着俄罗斯经济在本世纪变 强，普金开始强化该国贫乏的核设施。
随后，俄罗 斯国家原子能公司要求同美国建立更加平等的 研发关系。
（宗华） 调查发现望远镜观测时间分配存在性别歧视 GitHub：打造民主的数据库 科学家在软件开发网站共享数据和代码 当西非埃博拉疫情在2014年7月加速来袭时，CaitlinRivers开始收集关于受感染人群的数据。
当时还是计算流行病学专业博士生的Rivers想建立疫情扩散模型。
为此，她会每天下载PDF格式的更新数据，并且将数字转换成计算机可读的表格。
这些数据由遭到埃博拉病毒重创的各国卫生部发布。
不过，Rivers并未将这些文档据为己有，而是把它们发布到上。
这是一个广受欢迎的网站，旨在就软件代码开展协同工作。
Rivers觉得，发布的内容可能会吸引那些对埃博拉疫情最新信息感兴趣的人。
“我想，如果我需要它，其他人也会。
” Rivers是对的。
其他研究人员开始下载这些数据并为该项目作贡献。
在某些日子，第三方会赶在Rivers前面下载并转换各国卫生部的数据，然后将其加载到GitHub存储库。
其他人会创建程序脚本，从而对数据进行简单的错误检查，比如确保每天的患者数量是合理的。
当开始该项目时，Rivers是美国弗吉尼亚理工学院暨州立大学的博士生，如今则是陆军公共卫生中心的流行病学家。
成立于2008年的GitHub目前拥有约1500万用户，并且正成为一个日益受欢迎的网站，以供研究人员共享、维护和更新科学数据集以及代码。
澳大利亚麦考瑞大学生态学博士后DanielFalster表示，“当我们开始使用GitHub时，它简直让人称奇。
现在，我们做每件事情时都会用到它。
”Falster的生物质和异速生长数据库聚集了来自176项研究的关于植物大小的各项指标，并且被存放在GitHub上。
“开放的生命之树”项目也是如此。
其旨在汇编已发表的不同系统发育树，以建立一棵总的“生命之树”。
该项目利用GitHub储存数据文档和发表记录，并且 图片来源：projecttwins 接收来自第三方的最新数据集。
目前已有足够多的网站致力于数据分享。
不过，GitHub专门为透明、开放的合作而建，因为它利用版本控制软件追踪代码或数据发生的每一个改变。
这意味着大规模、分布式的程序员团队能在网络上共同开展一个项目，而用户可通过文件的版本记录进行实时回看，并在每个改变出现时，看到它是由谁以及处于何种目的做出的。
程序员可复制存储库以试验新想法；有用的改变会被并入主项目，其他改变则被忽视或者随后被返转。
例如，任何人都可以访问基于GitHub的“系外行星开放目录”，并且通过他们的浏览器提交新信息。
这是一个关于太阳系外上千颗已知行星且在不断增大的数据库。
和“开放的生命之树”一样，该项目的主网站在其URL地址中并未出现，因此临时访客不一定知道他们正在同版本控制软件进行互动。
然而，对于更加复杂的用户来说，文档在GitHub存储库中是可以公开获取的。
对文档进行的任何编辑都会通知包括加拿大多伦多大学天体物理学家HannoRein在内的项目开发者，以便回顾建议 作出的改变。
Rein表示，和静态的系外行星在线 目录相比，GitHub创造了“一种更加民主的方 式”，因为任何用户都可以提出修改意见，甚至 能根据他们自己的规范“量身定制”数据集版 本。
约有100人复制了该项目的存储库，而Rein 的运行同一数据库的智能手机应用程序“系外 行星”已吸引了约1000万次的下载。
GitHub依靠的软件工具被称为Git。
2005 年，Git由编码员LinusTorvalds创建，旨在管理 开源操作系统Linux的开发。
Linux是一个涉及 上千名独立程序员的大型项目。
“Git被用于对 源代码进行精细的逐行监控。
”GitHub项目经 理ArfonSmith介绍说，虽然它不是唯一可用的 版本控制软件，却是最流行的软件之
一。
数据共享是开放科学的核心要求，而研究 人员能在他们希望的任何地方共享数据集。
培 训研究人员使用数据的非营利性机构———“数 据木工”执行董事TracyTeal表示，即便不使用 ，科学家也应当考虑利用Git或者类 似工具记录对数据集和数据处理脚本做出的改 变。
而对学习使用Git和GitHub感兴趣的研究 人员可借助很多网络资源：和GitHub一样， Codecademy提供免费的交互式教程。
科研计算 技巧网站———“软件木工”创始人GregWilson 则在今年1月合著了一本操作手册。
同时，很多 程序员和生物信息学家在使用Git，因此他们总 是被要求提供帮助。
虽然有很多其他工具存在，但Git和 GitHub在科学家中拥有一个忠诚的“粉丝群”。
开放的生命之树”项目成员、加州大学默塞德分 校进化生物学家EmilyJaneMcTavish表示，它 们是必不可少的资源。
“如果没有它们，我不知 道该怎么活下去。
” （宗华编译） 调查发现，欧洲南方天文台望远镜观测时间分配存在性别歧视。
图片来源：IztokBoncina/ESO 如果想获得欧洲南方天文台（ESO）望远镜观 测时间的天文学家是女性，那么她申请成功的几 率要相对较小。
这是ESO开展的一项内部调查得 出的结论。
由男性主导的申请有22.2%的可能被选 中，而女性首席研究员只有16%的可能赢得观测时 间。
此项调查的作者、德国加尔兴ESO观测项目负 责人FerdinandoPatat表示，这种差异部分是因为 在天文学领域处于相对资深的职业层级上的男性 较多。
和博士后研究人员以及学生相比，专业天文 学家在获得观测时间上更容易成功。
与此同时，在 专业天文学家的申请者中，男性数量约是女性的
4 倍。
不过，Patat表示，评审流程无法被排除存在不 平等的性别对待。
当他将申请人的职业层级计算 在内时，成功率上的差距缩小，但并未完全消失： 和原始数据相比，男性的成功率为22.1%，而女性 的成功率略微上升至19.3%。
Patat还发现了性别带来的其他影响。
当分析 评审者如何对申请进行评级时，他发现男性和女 性评审者均倾向于将女性申请者的计划书排在后 面，而这种影响对于男性评审者来说更加糟糕。
女 性评审者将28%的来自女性的申请书和29.4%的 来自男性的申请书评为最高等级，而男性评审者 将23.5%的来自女性的申请书和27.1%的来自男性 的申请书评为最高等级。
Patat指出，评审者能看到 来自所有职业层级的申请书，因此评审过程似乎 存在一些依赖于性别的影响。
美国耶鲁大学天体物理学家MegUrry表示， 尽管此项调查发现职业层级在申请书评审过程中 产生最大影响，但要说性别歧视在天文学家领域 并不存在是不真实的。
“当你看一下科学界聘用人 员的标准，比如推荐信、论文被引用数量和教学评 估，便会发现所有这些标准实际上都存在性别偏 见。
” （徐徐）
数年来，他一直在用同样的鼠源克隆技术培养纤维，但这些却与众不同。
与之前他在英国邓迪的实验室培育出的纤维相比，它们需要更多的葡萄糖，而包含的能促进更快放松及不易疲劳的蛋白质则更少。
Khodabukus认为，这些不同归因于美国牛的饲养方式不同。
大多数大学实验室采用牛胎儿血清（FBS）培养细胞。
牛的饮食、地理位置、年龄、是否使用激素或抗体，以及牛胎儿孕周等均会产生影响。
FBS被作为培养基的补充物，它能影响人造组织的厚度，并能使产物模拟细胞活动，甚至影响表面接受器对给定化合物的响应。
“FBS就像笼罩在头上的乌云，我们不知道它实际是什么或不是什么。
”Khodabukus说。
而血清只是研究人员在研究细胞时需要考虑的诸多因素之
一。
在去年召开的美国国立卫生研究院（NIH）细胞培养和再生研讨会上，生物制药公司“吉利德科学”的癌症生物学家RichardNeve就担忧，研究人员将变得不堪重负。
“很多实验室面临大量问题。
” 一般而言，相关研究的最基本步骤是确保细胞的基因一致性。
而且，细胞行为也会受到浓度、增殖率、培养基、污染物和培养时间等的影响。
而血清是细胞培养基中最常见的补充物，并至少应保持一致。
通常，人类血清包含数千不同的蛋白质和小分子。
而FBS复杂性相似，且富含支持胎儿快速生长的物质。
致力于研发血清替代物的Essential制药公司的首席科学官AdamElhofy表示，在血清中，大部分细胞并不与血液直接接触，而是被液体包裹着。
“血清里还富含荷尔蒙、生长因子和其他信号分子。
” 走向无血清 为了克服障碍，试剂公司已经开发出无血清培养基。
科学家也在追求“生物工艺”的应用，例如，药用蛋白质和疫苗的生产。
而那些了解细胞对培养条件微小变化十分敏感的干细胞研究者也对此十分热衷。
出于对一致性的担忧和推动转化医学的愿望，越来越多的研究者开始注意如何对待他们的细胞。
MilliporeSigma公司研究部战略营销主管KenYoon表示，这些都在鼓励科学家远离血清。
但无血清培养基并非总是可行或实际的。
“如果我们能不再用FBS，而是有一些更确定的东西，所有人都同意这是件大事。
”美国国家综合医学科学研究所JonLorsch说，“问题是这有多切合实际？我们不知道答案。
” 大部分无血清剂型只针对特定细胞类型或相关细胞系群。
例如，供应商为中国仓鼠卵巢细胞提供无血清培养基。
但ScienCell实验室研发副总监JenniferWelser-Alves指出，这些培养基并不适用于所有细胞类型：许多原始细胞被移出后，仍需要血清才能生长。
“你能做的增加细胞并保持其增长的所有事情都是必要的。
”她说。
一些培养基要求增加至少2%的FBS，低剂量的血清有助于减少可变性。
“有的人博士学位泡汤了、拨款丢了，甚至几年的工作白干了，原因就是没有进行简单的质量控制。
图片来源：TekImage 不过，芒特普林森的培养基顾问PaulPrice指出，即便具有可行性，很多研究者也不希望花费时间或冒险掐断细胞的血清供应。
“自1980年以来，人们一直说血清将成为历史，但到现在它仍然流行。
” 另外，Khodabukus提到，骨骼肌纤维尚没有商用培养制剂。
他花费两年时间修改了配方，结合了数十种生长因子和其他信号分子。
但纤维性能随不同血清出现变化，打乱了他的研究计划。
“我计划用今后所有时间研究这一领域，如果能成功，则将能用于全世界每个实验室。
” 无法摆脱的血清 Khodabukus前博士后导师、加州大学戴维斯分校的KeithBaar则依靠一种更普通的解决方案：将实验室温度降低以储存血清。
当血清快要用尽时，他会订购和检验至少4批货源，观察他们培养的细胞的效能，找出与当前实验最匹配的。
之后，他购买了100瓶同样的血清。
虽然这会花费其实验室2.5万美元，但也意味着他们能继续实验，不用花数月时间检验更多的血清。
科罗拉多大学癌症生物学家MatthewSikora指出，不检验其血清的研究者可能陷入麻烦。
Sikora使用乳腺癌细胞系研究“弱雌激素”的效应。
他购买了经过木炭处理的血清，以便剥离类胆固醇激素和其他多脂分子。
然后他检验了血清中含有或缺乏雌激素受体的细胞，如果血清中的激素能被有效移除，那么这些细胞的增值效率应该一致。
去年，他和同事不得不停止实验6个月，当 时连续批次的血清均无法达到其实验目标。
不同的荷尔蒙容量会“完全推翻”对一种癌症药物如何工作的解释。
Sikora认为，血清中的未知变化能解释他与合作者不能得到一致结果的原因。
即便研究人员进行批次检验，他们也可能不知道应当注意什么。
但奥兰治儿童医院细胞和发育生物学家MariellaSimon表示，研究人员永远需要仔细。
理论上，他们应该准备充足的血清完成整个实验。
在使用一批新血清时，他们应该确保没有试剂发生变化，并与足够的旧血清进行比对，以避免因血清变化而出现的奇怪结果。
另外，污染也会扰乱实验。
最阴险的破坏者之一就是支原体。
这种微小的细菌能偷偷溜过消毒器的边缘，并能抵御多种抗生素。
它能吃掉细胞的营养并能改变DNA及蛋白质合成。
传统的支原体检验需要数周，并仍会遗漏一些稀有菌株。
美国模式培养物保藏所标准化工作负责人YvonneReid提到，基于聚合酶链反应（PCR）的检验能更快速准确地找到答案。
为了避免血清被污染，一些研究人员还选择使用伽马射线。
包括支原体在内的一些普通污染物均对射线十分敏感。
但射线也会损害蛋白质和生物活性分子的生长。
许多供应商也提供经过伽马射线照射的血清，国际血清产业联盟也成立了工作组检验这些血清的效果。
错误无处不在 细胞所处的物理环境具有深远影响。
美国波士顿威斯研究所研究人员发现，培养基仅出现变形和流动就会改变细胞。
不同品牌的实验 室器皿能将不同的化学物质释放到培养基中， 并扰乱细胞代谢研究。
经过认真考虑的试剂添加也能以意想不到 的方式改变细胞代谢：抗生素能损害线粒体活 性。
即便实验室冰箱的玻璃门也能摧毁研究，原 因是培养基中的一些化学物质对光线十分敏 感。
此外，细胞在给定的培养皿中的生长也不相 同。
在这些实验中，细胞本身就变成最大的变 数。
英国伦敦大学学院癌症研究员JohnMasters 指出，没有简单快速的方法能知道细胞是否符 合要求。
美国犹他州细胞培养顾问LelandFoster则 认为，“实验室要远离这种变量则需要有专业人 员指导。
”他指出，培养细胞最好由细胞培养专 家进行，而非实习生，前者能分辨出细胞在“微 笑还是皱眉头”。
在快速生长或相对稳定阶段的细胞，其反 应并不相同。
如果它们在培养基中的时间过 长，还会发生其他变化，并影响增殖。
即便能 确证细胞的遗传统一性，细胞的其他重要属 性也无法确证。
Reid提到，由于存在如此多的 不确定性，研究人员需要一周或更多时间优 化细胞生长，并在实验开始前总结生长概况。
生长概况能告知研究人员何时收获细胞、何 时检测等。
而重要的是，研究人员必须时刻保持警惕。
“没有一套实验规程适合所有人。
”Neve说。
但 忽视细胞的研究人员将会遇到更多困难。
“有的 人博士学位泡汤了、拨款丢了，甚至几年的工作 白干了，原因就是没有进行简单的质量控制。
” Masters说。
（张章编译） 科学线人 全球科技政策新闻与解析 俄罗斯中止俄美核研发协议 即便俄罗斯暂停同美国的核研发合作，在波兰和其他国家消除高浓缩铀的共同努力似乎仍在进行。
图片来源：
U.S.NNSA 美国官员表示，即便是在冷战期间，事情也从 未如此糟糕。
近日，俄罗斯政府暂停了一项和美国 就核研发合作达成的协议，并且终止了另一项就 改装俄罗斯研究用反应堆使其不再使用武器级铀 燃料达成的协议。
虽然这些举措在很大程度上是 象征性的，但还是令这两个全球实力最强的核大 国之间的关系跌入新的低谷，并且在25年前苏联 解体后形成密切关系的核科学界引起隔阂。
在宣布暂停研发协议时，俄罗斯政府将其称 为对美国制裁采取的“对策”。
在2014年3月克里 米亚事件后，美国对俄罗斯实施了制裁，并为乌克 兰东部地方武装提供支持。
有消息人士表示，叙利 亚和平谈判的崩溃以及美国对俄罗斯参与轰炸叙 利亚阿勒波的指责，似乎促成了俄罗斯延迟的反 击。
10月3日，俄罗斯还退出了同美国达成的另
一 项协议。
根据协议，双方将致力于消除存放在两国 的34吨钚。
这些钚足以生产约1.7万颗炸弹。
“看到俄罗斯这样做，我们真的非常遗憾。
”美 国能源部国家核能安全管理局（NNSA）一名官员 表示。
总部位于华盛顿、倡导核不扩散的非营利性 机构———“核威胁倡议”的核材料安全和危害最小 化项目副主席AndrewBieniawski则认为，作为迄 今拥有最大核武库的两个国家，“美国和俄罗斯肩 负着合作共事的特殊责任”。
上述NNSA官员表示，俄罗斯暂停于2013 年9月签订的核研发协议“尤其令人遗憾”。
他认 为，该协议是“苏联解体后双方以平等地位合作 达成的首个框架协议”。
在1991年苏联解体后， 美国对俄罗斯核设施的援助主要集中在确保核 材料安全并将核武器专家分配到民用项目上。
不 过，俄罗斯总统弗拉基米尔·普京一直对美国伸 出的援手感到恼火。
随着俄罗斯经济在本世纪变 强，普金开始强化该国贫乏的核设施。
随后，俄罗 斯国家原子能公司要求同美国建立更加平等的 研发关系。
（宗华） 调查发现望远镜观测时间分配存在性别歧视 GitHub：打造民主的数据库 科学家在软件开发网站共享数据和代码 当西非埃博拉疫情在2014年7月加速来袭时，CaitlinRivers开始收集关于受感染人群的数据。
当时还是计算流行病学专业博士生的Rivers想建立疫情扩散模型。
为此，她会每天下载PDF格式的更新数据，并且将数字转换成计算机可读的表格。
这些数据由遭到埃博拉病毒重创的各国卫生部发布。
不过，Rivers并未将这些文档据为己有，而是把它们发布到上。
这是一个广受欢迎的网站，旨在就软件代码开展协同工作。
Rivers觉得，发布的内容可能会吸引那些对埃博拉疫情最新信息感兴趣的人。
“我想，如果我需要它，其他人也会。
” Rivers是对的。
其他研究人员开始下载这些数据并为该项目作贡献。
在某些日子，第三方会赶在Rivers前面下载并转换各国卫生部的数据，然后将其加载到GitHub存储库。
其他人会创建程序脚本，从而对数据进行简单的错误检查，比如确保每天的患者数量是合理的。
当开始该项目时，Rivers是美国弗吉尼亚理工学院暨州立大学的博士生，如今则是陆军公共卫生中心的流行病学家。
成立于2008年的GitHub目前拥有约1500万用户，并且正成为一个日益受欢迎的网站，以供研究人员共享、维护和更新科学数据集以及代码。
澳大利亚麦考瑞大学生态学博士后DanielFalster表示，“当我们开始使用GitHub时，它简直让人称奇。
现在，我们做每件事情时都会用到它。
”Falster的生物质和异速生长数据库聚集了来自176项研究的关于植物大小的各项指标，并且被存放在GitHub上。
“开放的生命之树”项目也是如此。
其旨在汇编已发表的不同系统发育树，以建立一棵总的“生命之树”。
该项目利用GitHub储存数据文档和发表记录，并且 图片来源：projecttwins 接收来自第三方的最新数据集。
目前已有足够多的网站致力于数据分享。
不过，GitHub专门为透明、开放的合作而建，因为它利用版本控制软件追踪代码或数据发生的每一个改变。
这意味着大规模、分布式的程序员团队能在网络上共同开展一个项目，而用户可通过文件的版本记录进行实时回看，并在每个改变出现时，看到它是由谁以及处于何种目的做出的。
程序员可复制存储库以试验新想法；有用的改变会被并入主项目，其他改变则被忽视或者随后被返转。
例如，任何人都可以访问基于GitHub的“系外行星开放目录”，并且通过他们的浏览器提交新信息。
这是一个关于太阳系外上千颗已知行星且在不断增大的数据库。
和“开放的生命之树”一样，该项目的主网站在其URL地址中并未出现，因此临时访客不一定知道他们正在同版本控制软件进行互动。
然而，对于更加复杂的用户来说，文档在GitHub存储库中是可以公开获取的。
对文档进行的任何编辑都会通知包括加拿大多伦多大学天体物理学家HannoRein在内的项目开发者，以便回顾建议 作出的改变。
Rein表示，和静态的系外行星在线 目录相比，GitHub创造了“一种更加民主的方 式”，因为任何用户都可以提出修改意见，甚至 能根据他们自己的规范“量身定制”数据集版 本。
约有100人复制了该项目的存储库，而Rein 的运行同一数据库的智能手机应用程序“系外 行星”已吸引了约1000万次的下载。
GitHub依靠的软件工具被称为Git。
2005 年，Git由编码员LinusTorvalds创建，旨在管理 开源操作系统Linux的开发。
Linux是一个涉及 上千名独立程序员的大型项目。
“Git被用于对 源代码进行精细的逐行监控。
”GitHub项目经 理ArfonSmith介绍说，虽然它不是唯一可用的 版本控制软件，却是最流行的软件之
一。
数据共享是开放科学的核心要求，而研究 人员能在他们希望的任何地方共享数据集。
培 训研究人员使用数据的非营利性机构———“数 据木工”执行董事TracyTeal表示，即便不使用 ，科学家也应当考虑利用Git或者类 似工具记录对数据集和数据处理脚本做出的改 变。
而对学习使用Git和GitHub感兴趣的研究 人员可借助很多网络资源：和GitHub一样， Codecademy提供免费的交互式教程。
科研计算 技巧网站———“软件木工”创始人GregWilson 则在今年1月合著了一本操作手册。
同时，很多 程序员和生物信息学家在使用Git，因此他们总 是被要求提供帮助。
虽然有很多其他工具存在，但Git和 GitHub在科学家中拥有一个忠诚的“粉丝群”。
开放的生命之树”项目成员、加州大学默塞德分 校进化生物学家EmilyJaneMcTavish表示，它 们是必不可少的资源。
“如果没有它们，我不知 道该怎么活下去。
” （宗华编译） 调查发现，欧洲南方天文台望远镜观测时间分配存在性别歧视。
图片来源：IztokBoncina/ESO 如果想获得欧洲南方天文台（ESO）望远镜观 测时间的天文学家是女性，那么她申请成功的几 率要相对较小。
这是ESO开展的一项内部调查得 出的结论。
由男性主导的申请有22.2%的可能被选 中，而女性首席研究员只有16%的可能赢得观测时 间。
此项调查的作者、德国加尔兴ESO观测项目负 责人FerdinandoPatat表示，这种差异部分是因为 在天文学领域处于相对资深的职业层级上的男性 较多。
和博士后研究人员以及学生相比，专业天文 学家在获得观测时间上更容易成功。
与此同时，在 专业天文学家的申请者中，男性数量约是女性的
4 倍。
不过，Patat表示，评审流程无法被排除存在不 平等的性别对待。
当他将申请人的职业层级计算 在内时，成功率上的差距缩小，但并未完全消失： 和原始数据相比，男性的成功率为22.1%，而女性 的成功率略微上升至19.3%。
Patat还发现了性别带来的其他影响。
当分析 评审者如何对申请进行评级时，他发现男性和女 性评审者均倾向于将女性申请者的计划书排在后 面，而这种影响对于男性评审者来说更加糟糕。
女 性评审者将28%的来自女性的申请书和29.4%的 来自男性的申请书评为最高等级，而男性评审者 将23.5%的来自女性的申请书和27.1%的来自男性 的申请书评为最高等级。
Patat指出，评审者能看到 来自所有职业层级的申请书，因此评审过程似乎 存在一些依赖于性别的影响。
美国耶鲁大学天体物理学家MegUrry表示， 尽管此项调查发现职业层级在申请书评审过程中 产生最大影响，但要说性别歧视在天文学家领域 并不存在是不真实的。
“当你看一下科学界聘用人 员的标准，比如推荐信、论文被引用数量和教学评 估，便会发现所有这些标准实际上都存在性别偏 见。
” （徐徐）
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